오픈 리딩 프레임

오픈 리딩 프레임 (Open Reading Frame, ORF) 은 분자생물학에서 유전자 내에서 시작 코돈 (보통 AUG)으로부터 시작하여 종결 코돈 (UAA, UAG, UGA)으로 끝나는, 단백질로 번역될 수 있는 연속적인 DNA 염기서열을 의미한다. ORF는 유전자의 일부일 수도 있고, 독립적인 유전자의 전부일 수도 있다.

일반적으로, 긴 ORF는 실제로 단백질을 코딩하는 유전자의 존재를 예측하는 데 사용된다. 게놈 서열 분석 후, 컴퓨터 프로그램을 사용하여 긴 ORF를 식별하고, 이를 바탕으로 단백질을 코딩할 가능성이 높은 영역을 예측한다. 그러나 모든 ORF가 실제로 단백질로 번역되는 것은 아니다. 짧은 ORF나, 진핵생물의 경우 스플라이싱 과정에서 제거되는 인트론 내부에 존재하는 ORF는 단백질로 번역되지 않을 수 있다. 또한, 일부 ORF는 진화 과정에서 기능을 잃어버린 가짜 유전자(Pseudogene)의 일부일 수도 있다.

ORF를 식별하는 것은 유전체 주석(Genome annotation)의 중요한 단계이며, 이를 통해 새로운 유전자를 발견하고 그 기능을 예측하는 데 도움을 준다. ORF의 길이, 서열 보존성, 발현 패턴 등을 분석하여 실제 단백질을 코딩하는 ORF와 그렇지 않은 ORF를 구별하는 것이 중요하다.