샤인-달가노 서열

정의: 샤인-달가노 서열은 세균과 고세균의 mRNA에서 리보솜 결합 부위(Ribosome Binding Site, RBS)로 작용하는 짧은 염기 서열이다. 이 서열은 리보솜의 16S rRNA의 3' 말단에 있는 상보적인 서열과 결합하여, mRNA에 리보솜이 결합하고 단백질 합성이 시작되는 것을 돕는다. 즉, 번역 개시 과정에 필수적인 역할을 한다.

발견: 1974년 존 샤인(John Shine)과 라이너 달가노(Lynn Dalgarno)에 의해 발견되어 그들의 이름을 따 명명되었다. 이들은 다양한 세균 mRNA를 분석하여 번역 개시 코돈(AUG) 상류에 특정 염기 서열이 보존적으로 나타나는 것을 확인하였다.

서열: 샤인-달가노 서열의 정확한 서열은 종에 따라 다소 차이가 있지만, 일반적으로 AGGAGGU 와 유사한 퓨린이 풍부한 서열을 갖는다. 이 서열은 번역 개시 코돈(AUG) 상류 3~9 뉴클레오타이드 위치에 위치한다. 완벽한 상보성을 가질 필요는 없으며, 일정 수준의 상보성만으로도 리보솜 결합에 충분하다.

기능: 샤인-달가노 서열은 리보솜의 16S rRNA의 3' 말단에 위치한 안티-샤인-달가노 서열(Anti-Shine-Dalgarno sequence)과 상호작용하여 리보솜을 mRNA에 정확하게 위치시킨다. 이러한 상호작용은 번역 개시 복합체(translation initiation complex) 형성에 필수적이며, 단백질 합성의 효율성을 높이는 역할을 한다. 샤인-달가노 서열의 변이 또는 결실은 단백질 합성의 효율 저하를 초래할 수 있다.

관련 용어: 리보솜 결합 부위 (Ribosome Binding Site, RBS), 번역 개시 코돈 (Start Codon), 16S rRNA, 안티-샤인-달가노 서열 (Anti-Shine-Dalgarno sequence), 번역 개시 복합체 (Translation Initiation Complex)

참고: 샤인-달가노 서열은 세균과 고세균에서 주로 발견되며, 진핵생물에서는 일반적으로 발견되지 않는다. 진핵생물은 리보솜 결합과 번역 개시 과정에 다른 메커니즘을 사용한다.