MSL 마이너리그(MSL Minor League)는 MBC게임이 주최한 스타크래프트 개인리그 시스템의 일부로, MSL(MBC게임 스타리그) 본선 진출자를 선발하기 위해 개최된 예선 성격의 하위 리그이다.
2003년에 처음 개최되어 2004년까지 총 5차례(1차~5차)에 걸쳐 진행되었다. 초기에는 24명의 선수가 3전 2선승제의 단순 토너먼트 방식으로 경쟁하여 12명이 본선에 진출하는 방식이었으나, 이후 조별 풀리그, 16강 토너먼트, 리그결정전 등으로 점차 방식이 발전·변경되었다. 2005년부터는 MSL 서바이버리그로 대체되면서 완전히 폐지되었다.
각 차수의 마이너리그는 시드권자(전 시즌 탈락자)와 마이너결정전(또는 마이너진출전)을 통과한 진출자들이 합류하여 경쟁하는 구조로 운영되었다. 홍진호, 임요환, 최연성, 박성준, 마재윤, 이윤열 등 당대 스타크래프트 프로게이머들이 이 리그를 통해 MSL 본선에 진출한 것으로 기록되어 있다.
주관 방송사는 MBC게임이었으며, 경기는 MBC게임 세중게임월드 등에서 진행되었다. 공식 맵으로는 JRs Memory, Plains to Hill, Enter the Dragon, Luna, Into the Darkness, Arizona 등이 사용되었다.
