2016년 AFC컵은 아시아 축구 연맹(AFC)이 주관하는 아시아 클럽 축구 대항전인 AFC컵의 13번째 시즌이었다. 이 대회는 아시아축구연맹 챔피언스리그 다음으로 권위 있는 대회로, 주로 신흥 축구 강국의 클럽들이 참가한다. 2016년 AFC컵은 2016년 2월 23일 조별 리그를 시작으로 같은 해 11월 5일 결승전까지 진행되었다.
개요 총 31개 팀이 아시아 각 지역(서아시아, 중앙아시아, 남아시아, 동아시아, 아세안)을 대표하여 참가했으며, 각 지역 예선 및 조별 리그를 거쳐 본선 토너먼트에 진출했다. 대회 방식은 조별 리그 후 16강, 8강, 준결승, 결승 순으로 진행되는 단판 또는 홈 앤드 어웨이 토너먼트 형식이었다.
주요 결과 대회 결승전은 2016년 11월 5일 카타르 도하에 위치한 수하임 빈 하마드 스타디움에서 열렸다. 결승전에는 이라크의 알쿠와 알자위야(Al-Quwa Al-Jawiya)와 인도의 벵갈루루 FC(Bengaluru FC)가 맞붙었다. 알쿠와 알자위야는 1대0 승리를 거두며 클럽 역사상 첫 AFC컵 우승을 차지하는 영광을 안았다. 이 승리로 알쿠와 알자위야는 다음 시즌 AFC 챔피언스리그 플레이오프 진출권을 획득했다. 특히 벵갈루루 FC는 인도 클럽으로는 처음으로 AFC컵 결승에 진출하며 주목받기도 했다.
개인 수상 및 통계 대회 득점왕은 알쿠와 알자위야 소속의 하마디 아흐메드(Hammadi Ahmed) 선수가 16골을 기록하며 차지했다. 그는 팀의 우승에 결정적인 기여를 했다.