황서종(黃曙鍾, 1961년 ~ )은 대한민국의 공무원이다. 전라남도 강진군에서 출생하였으며, 광주동신고등학교와 서울대학교 외교학과를 졸업하였다. 이후 미국 인디애나대학교 대학원에서 행정학 석사 학위를, 서울시립대학교 대학원에서 행정학 박사 학위를 취득하였다.
제31회 행정고시에 합격하여 공직에 입문하였으며, 행정안전부 공무원노사협력관, 정보화기획관, 안전행정부 인사정책관, 인사혁신처 인사혁신국장 및 차장을 역임하였다. 2016년부터 2018년까지 소청심사위원회 상임위원으로 재직하였고, 2018년 12월부터 2021년 3월까지 제4대 인사혁신처장을 지냈다. 이후 2021년 6월부터 2023년 3월까지 공무원연금공단 이사장을 역임하였으며, 임기 중 사의를 표명하여 퇴임하였다.