허버트 웨인 보이어 (Herbert Wayne Boyer, 1936년 7월 13일 ~ )는 미국의 생화학자이자 기업가이다. 유전자 재조합 기술을 개발하여 현대 생명공학의 발전에 크게 기여했으며, 벤처 기업 제넨테크(Genentech)의 공동 창립자이다.
보이어는 펜실베이니아주 피츠버그 근교에서 태어나 세인트 빈센트 대학에서 생물학과 화학을 전공했다. 이후 피츠버그 대학교에서 박사 학위를 받은 후, 스탠퍼드 대학교와 캘리포니아 대학교 샌프란시스코 캠퍼스에서 연구를 진행했다.
1970년대 초, 보이어는 제한 효소를 이용하여 DNA를 절단하고 재조합하는 기술을 개발하는 데 성공했다. 특히 스탠리 코헨과의 협력을 통해 플라스미드를 이용하여 유전자를 복제하는 방법을 개발하여 유전자 재조합 기술의 기반을 마련했다. 이 기술은 인슐린, 성장 호르몬 등 다양한 의약품 생산에 활용되었으며, 농업, 환경 등 다양한 분야에도 응용되었다.
1976년, 보이어는 벤처 투자자 로버트 스완슨과 함께 제넨테크를 공동 창립했다. 제넨테크는 유전자 재조합 기술을 상업적으로 활용한 최초의 생명공학 기업 중 하나이며, 인슐린, 성장 호르몬 등 다양한 의약품을 개발하여 생명공학 산업의 성장을 이끌었다.
보이어는 유전자 재조합 기술 개발 및 생명공학 산업 발전에 기여한 공로로 1990년 미국 국가 과학 훈장, 1996년 레멜슨-MIT상 등 다수의 상을 수상했다. 또한 미국 국립 과학 아카데미 회원, 미국 예술 과학 아카데미 회원으로 선출되었다.