한국뇌과학연구원은 대한민국에서 뇌와 인체 기능의 작용 원리에 관한 연구를 수행하는 재단법인이다. 구 명칭은 한국인체과학연구원으로, 1990년 12월에 설립되었다. 이후 2002년 8월 현재의 명칭인 한국뇌과학연구원으로 개칭되었다.
이 연구원은 인간의 뇌에 대한 근본적 탐구를 바탕으로 뇌의 실제적 활용과 개발 분야를 중점적으로 연구하는 기관으로, 과학기술정보통신부에 등록된 재단법인이다. 설립 목적은 뇌와 인체 기능의 작용 원리에 관한 연구를 통해 인간 뇌의 잠재능력을 일깨우는 방법을 개발·보급하고, 미래 산업 혁명의 핵심 기술을 개발함으로써 국가 경쟁력 제고와 인류 문명의 진보에 기여하는 것으로 명시되어 있다.
한국뇌과학연구원의 주요 활동으로는 뇌 활용 전문지 《브레인》의 발간, 2005년 국제브레인HSP올림피아드 창설 등이 있다. 또한 2007년 7월에는 유엔 경제사회이사회(ECOSOC)로부터 유엔 협의지위(Consultative Status, Roster 등급)를 취득하여 미국 뉴욕에 연락사무소를 개설한 바 있다.
사무실은 서울특별시 강남구 신사동에 위치해 있다.
한편, 이 기관은 대한민국 정부가 설립한 별개의 출연연구기관인 한국뇌연구원(KBRI, Korea Brain Research Institute)과는 구별되는 별개의 법인이다. 한국뇌연구원은 1998년 제정된 뇌연구촉진법에 근거하여 2011년 설립된 과학기술정보통신부 산하 정부출연연구기관으로, 기관의 성격과 운영 주체가 서로 다르다.
