한국나노기술원(韓國-技術院, Korea Advanced Nano Fab Center)은 나노기술의 국가경쟁력 제고와 산업 발전에 기여하기 위해 설립된 비실리콘계 나노기술 연구기관이다. 과학기술정보통신부 산하 기타공공기관으로 지정되어 있으며, 사무소는 경기도 수원시 영통구 광교로 109에 위치해 있다.
한국나노기술원의 연혁을 살펴보면, 2003년 「나노기술개발촉진법」이 제정 시행됨에 따라 같은 해 12월 26일 '재단법인 나노소자특화팹센터'로 설립되었다. 이후 2012년 5월 16일 명칭을 현재의 '한국나노기술원'으로 변경하였고, 2016년 2월 기획재정부로부터 기타공공기관으로 지정되었다(기재부 고시 제16-2호).
기관의 주요 조직으로는 융합공정기술본부(공정기술실, 집적공정실, 품질보증실, 종합분석신뢰성인증센터 등), 소자기술개발본부(광소자개발실, 전자소자개발실), 경영지원본부(경영혁신실, 기업지원실), 그 외 선임본부장 산하의 지속성장전략팀, 대외협력처, 나노인력양성사업단, 지역협력사업단 등이 있다.
한국나노기술원은 화합물반도체 등 비실리콘계 나노기술 분야의 연구개발 및 공정 지원, 공동활용 서비스 등을 제공하는 국가 나노인프라 기관으로 기능하고 있다. 특히 반도체 R&D와 첨단산업 기술 개발을 뒷받침하는 공공 기반시설의 역할을 수행하며, 2026년에는 과학기술정보통신부로부터 '나노기술개발촉진법' 제11조에 따라 공공나노팹센터로 지정되어 산·학·연 연구자와 기업에 나노기술 연구개발, 공정 지원, 공동활용 서비스 등을 제공하고 있다.