존스턴의 기관(Johnston's organ)은 곤충강(Insecta)의 더듬이(antennae)에서 발견되는 감각 세포의 집합체이다. 구체적으로 더듬이의 두 번째 마디인 소경(자루마디, pedicel) 내부에 위치하며, 더듬이의 세 번째이자 일반적으로 마지막 마디인 편모(채찍마디, flagellum)의 움직임을 감지하는 역할을 한다.
구조적으로 존스턴의 기관은 그릇 모양으로 배열된 다수의 현음감각기(척색감각기, scolopidia)로 구성되어 있으며, 각 현음감각기는 하나의 기계감각 척색 신경세포(mechanosensory chordotonal neuron)를 포함한다. 현음감각기의 수는 종에 따라 크게 차이가 나는데, 예를 들어 동족류(매미목, Homoptera)에서는 25~79개, 초파리(Drosophila melanogaster)에서는 약 480개, 모기 수컷의 경우 약 15,000개(이는 사람의 달팽이관 sensory cell 수와 유사하다)에 달한다.
생물학적 분류에서 존스턴의 기관의 존재는 곤충강(Insecta)을 속입틀군(Entognatha)에 속하는 다른 육족류(hexapods)와 구분하는 정의적 특징으로 간주된다.
기능 측면에서 존스턴의 기관은 다목적 감각 기관이다. 초파리와 모기류에서는 상대방의 날갯짓 주파수를 감지하여 짝을 찾는 청각 기관으로 기능하며, 암컷 모기와 달리 수컷 모기에서 특히 발달되어 있다. 초파리의 경우 존스턴의 기관의 서로 다른 신경세포 집단이 중력(gravity)에 의한 더듬이 변위와 소리나 공기 흐름에 의한 진동을 각각 다르게 감지함으로써, 중력 자극, 기계적 자극, 음향 자극을 구별할 수 있다. 또한 날아가는 동안 시각 유도 선회(visually induced turn) 시 날개에 의해 발생하는 공기 흐름의 변화를 감지하여 선회 반응을 제어하는 데에도 관여한다.
박각시나방(hawk moth)에서는 존스턴의 기관이 비행 중 자세 안정성 제어에 중요한 역할을 한다. 복잡한 비행 중 각 운동량 변화로 인해 발생하는 코리올리 힘(Coriolis force)에 의한 더듬이 진동(약 60Hz)을 감지하도록 특화되어 있다. 꿀벌의 경우 존스턴의 기관을 통해 꿀벌춤(waggle dance) 시 방출되는 근거리 음장 신호(near-field sound)를 수신하며, 나아가 날갯짓으로 발생하는 전기장 변화까지 감지할 수 있는 것으로 알려져 있다.
이 기관은 1855년 미국의 의사 크리스토퍼 존스턴(Christopher Johnston, 1822~1891)이 학술지 《Quarterly Journal of Microscopical Science》에 발표한 "Auditory Apparatus of the Culex Mosquito"라는 논문에서 최초로 기술하였으며, 그의 이름을 따서 명명되었다.