제퍼슨군은 미국의 일리노이주에 위치한 군(郡, county)이다. 군청 소재지는 마운트버넌(Mount Vernon)이다. 이 군은 미국의 제3대 대통령 토머스 제퍼슨(Thomas Jefferson)의 이름을 따서 명명되었다.
역사 제퍼슨군은 1819년에 설립되었다.
지리 제퍼슨군은 일리노이주 남부에 위치한다. 총 면적은 약 1,490 제곱킬로미터 (575 제곱마일)이며, 이 중 약 1,478 제곱킬로미터 (571 제곱마일)가 육지이고 나머지는 수면이다. 북쪽으로는 매리언군(Marion County), 동쪽으로는 웨인군(Wayne County), 남동쪽으로는 해밀턴군(Hamilton County), 남쪽으로는 프랭클린군(Franklin County), 남서쪽으로는 페리군(Perry County), 서쪽으로는 워싱턴군(Washington County)과 접한다. 주요 교통로로는 57번 주간고속도로(Interstate 57)가 군을 관통한다.
인구 2020년 미국 인구조사 기준 제퍼슨군의 인구는 37,113명이다.