유제류 생물 목록은 발굽이 있는 포유류인 유제류(Ungulata, 有蹄類)의 분류학적 체계를 정리한 목록이다. 유제류는 포유강(Mammalia)에 속하는 분류군으로, 전통적으로 발굽(hoof)을 가진 동물들을 지칭해 왔다. 다만 현대 분자생물학적 연구에 따르면, 과거 'Ungulata'로 묶였던 분류군 중 일부(코끼리, 바위너구리, 바다소, 땅돼지 등)는 아프로테리아상목(Afrotheria)에 속하는 것으로 밝혀져 다계통군(polyphyletic group)으로 판명되었으며, 현재는 진유제류(Euungulata)라는 분기군으로 재정의되고 있다.
유제류 생물 목록은 크게 다음과 같은 분류 체계로 구성된다.
메삭소니아(Mesaxonia, 범기제류) 체중이 제3발가락에 집중되는 축성각(axonic) 발 구조를 가진 분류군이다.
- †페나코두스과(Phenacodontidae) — 고대 유제류의 기저 분류군
- †공각목(Dinocerata, 恐角目) — 우인타테리움과(Uintatheriidae) 등
- †이제목(Xenungulata, 異蹄目) — 카로드니아과(Carodniidae)
- †안트라코부네류(Anthracobunia) — 안트라코부네과, 캄바이테리움과
- †속주목(Desmostylia, 束柱目) — 데스모스틸루스과, 팔레오파라독시아과
- †활거목(Litopterna, 滑距目) — 디돌로두스과, 노토니콥스과, 프로톨립테르나과, 스파르노테리오돈과, 로폴립테르나(프로테로테리움상과, 마크라우케니아과 등)
- †남제목(Notoungulata, 南蹄目) — 노티오프로고니아아목, 톡소돈아목, 티포테리아아목
- †휘수목(Astrapotheria, 輝獸目) — 아스트라포테리움과, 에오아스트라포스틸롭스과, 트리고노스틸롭스과
- 기제목(Perissodactyla, 奇蹄目) — 현존하는 유제류 중 하나로, 말과(Equidae), 맥과(Tapiridae), 코뿔소과(Rhinocerotidae)를 포함한다.
파락소니아(Paraxonia) 체중이 제3·4발가락에 분산되는 구조를 가진 분류군이다.
- †페리프티쿠스과(Periptychidae)
- †아르크토키온목(Arctocyonia) — 아르크토키온과, 옥시클라이누스과, 쿠에타키온과
- †메소닉스목(Mesonychia) — 하팔로덱테스과, 메소닉스과, 트리소돈과
- 우제목(Artiodactyla, 偶蹄目) — 현존하는 유제류로, 여기에는 낙타과(Camelidae), 페커리과(Tayassuidae), 돼지과(Suidae), 소과(Bovidae), 사슴과(Cervidae), 기린과(Giraffidae), 가지뿔영양과(Antilocapridae), 사향노루과(Moschidae) 등이 포함된다. 분자생물학적 연구 결과 고래목(Cetacea, 돌고래·고래류)도 우제목의 하위 분기군으로 분류된다.
이 목록은 나무위키 등 위키 기반 정보원에서 '태반하강 생물 목록'의 하위 문서로 정리되어 있으며, 멸종한 분류군(† 표시)과 현존 분류군을 모두 포함한다. 기제목과 우제목의 세부 종 목록은 각각 '기제목 생물 목록' 및 '우제목 생물 목록' 문서에서 더 상세히 다루어진다. 분자계통학의 발전에 따라 분류 체계는 지속적으로 수정·보완되고 있다.