여주종합터미널(공식 명칭: 여주종합버스터미널, Yeoju Bus Terminal)은 경기도 여주시 세종로 85(홍문동 274-1)에 위치한 대한민국의 버스 터미널이다. 고속버스 전산망상의 터미널 번호는 140이다.
1992년 7월 9일에 건립되었으며, (주)여주터미널상사에서 운영하고 있다. 전체 건물 연면적은 16,479m², 대합실 면적은 1,011m²이다. 2019년 1월 기준 하루 평균 약 1,500명이 이용하고 23개 노선이 운행 중이다.
고속버스 노선으로는 여주대학교를 경유하여 서울고속버스터미널(서울경부)을 오가는 노선이 있으며, 배차간격은 20~30분이다. 시외버스 노선으로는 이천, 대전, 청주, 원주, 강릉, 인천, 전주, 마산·창원, 수원, 동서울, 김포공항, 인천공항 등 다양한 방면으로 운행된다. 또한 경기고속, 경남여객, 금강고속, 대원고속 소속의 시내버스도 이 터미널을 이용할 수 있다.
터미널 내부에서는 시내버스(금강고속, 백성운수 등)도 승하차가 가능하며, 인근에 여주대학교 정류소가 있어 서울고속버스 노선이 여주대학교를 경유하여 운행된다.