쉬보이간군(Cheboygan County)은 미국 미시간주 북부에 위치한 군(郡, county)이다. 군청 소재지는 쉬보이간(Cheboygan)이며, 휴런호(Lake Huron)와 미시간호(Lake Michigan)를 연결하는 매키노 해협(Straits of Mackinac) 인근에 자리하고 있다. 1840년에 경계가 설정되었으며, 미칠리매키낙군(Michilimackinac County)에서 분할되어 형성되었다.
2010년 미국 인구조사 기준 인구는 26,152명이었으며, 2020년 인구조사에서는 25,579명으로 집계되었다. 주요 산업으로는 관광업, 제조업, 임업 등이 있다. 이 지역은 매키노 시티(Mackinaw City) 등 휴양지와 인접해 있어 여름철 관광객이 많이 찾는 지역이다.
'쉬보이간(Cheboygan)'이라는 명칭은 원주민 언어에서 유래한 것으로 알려져 있으나, 정확한 어원에 대해서는 여러 설이 존재한다.
