소수 종교는 특정 사회나 국가에서 신자 수가 적은 종교를 가리키는 개념이다. 이는 절대적인 신자 수의 많고 적음보다는, 해당 사회의 주류 종교와 비교하여 상대적으로 적은 수의 신자를 가진 종교를 의미한다. 따라서 세계적으로 신자가 많은 종교라도 특정 국가나 지역에서는 소수 종교로 분류될 수 있다. 예를 들어 이슬람교는 서남아시아 지역에서는 다수 종교이지만, 대한민국이나 일본과 같은 국가에서는 신자 수가 적어 소수 종교에 해당한다.
소수 종교의 개념은 종교적 소수자(minority religion / religious minority)라는 사회학적 개념과도 연결된다. 종교적 소수자는 단순히 인구 수의 열세뿐 아니라, 해당 종교를 신봉함으로 인해 사회적으로 차별받거나 소외되거나 권리상의 불이익을 받는 집단을 가리키기도 한다. 국제법적으로는 시민적 및 정치적 권리에 관한 국제규약(ICCPR) 제27조에서 인종, 종교 및 언어상의 소수자가 자신의 문화를 향유하고 종교를 표명하며 언어를 사용할 권리를 보장하고 있다.
소수 종교의 범주에는 특정 지역에서 소수인 세계 주요 종교의 신자들, 신흥 종교(신종교), 토착 신앙, 그리고 무종교인이나 무신론자 집단 등이 포함될 수 있다. 역사적으로 소수 종교 집단은 주류 종교와의 관계에서 차별이나 박해를 경험한 사례가 많으며, 현대에도 일부 국가에서는 종교적 소수자에 대한 법적·사회적 제한이 존재한다.
소수 종교는 신흥 종교(new religious movement)나 사이비 종교와 혼동되기도 하나, 이들은 개념상 구분된다. 신흥 종교는 기존 종교에 비해 성립 시기가 짧은 종교를 가리키는 가치 중립적 용어이며, 사이비 종교는 반사회적 행태를 보이는 집단을 지칭하는 부정적 의미의 용어이다. 소수 종교는 이와 달리 단순히 신자 수의 적음에 초점을 맞춘 상대적 개념으로, 반드시 신흥 종교나 사이비 종교를 의미하지는 않는다.
