세르게이 흐루쇼프(Sergei Nikitich Khrushchev, 1935년 7월 30일 ~ 2020년 6월 18일)는 소련의 공학자이자 미국의 정치학자로, 소련 제1서기 니키타 흐루쇼프의 차남이다.
소련 모스크바에서 태어나 모스크바 전력공학대를 졸업한 후, 미사일 및 우주 개발 분야의 공학자로 활동했다. 1960년대에는 소련의 미사일 통제 시스템 개발에 참여하였으며, 아버지 니키타 흐루쇼프가 실각한 후에도 학계에 남아 연구를 지속했다.
1991년 소련 해체 이후 미국으로 이주하여 1996년 미국 시민권을 취득했다. 이후 브라운 대학교 왓슨 국제학 연구소(Watson Institute for International Studies)의 선임 연구원으로 재직하며 소련 시기 정치사, 냉전사, 미사일 개발사 등에 관해 강의하고 저술 활동을 벌였다. 주요 저서로는 『니키타 흐루쇼프와 평화적 공존』, 『흐루쇼프의 회고록』 편찬 작업 참여 등이 있다.
2020년 6월 18일 미국 로드아일랜드 주 크랜스턴의 자택에서 사망하였으며, 사인은 총상으로 인한 자살로 판정되었다.