성기(性器)는 유성 생식을 수행하는 생물체의 해부학적 기관으로, 생식기(生殖器)라고도 불린다. 이 용어는 동물과 식물 모두에 적용될 수 있으며, 동물에서는 생식샘(생선)과 교접기 등을, 식물에서는 포자낭이나 배우자낭 등을 가리킨다. 꽃은 속씨식물의 생식기이며, 솔방울은 구과식물의 생식 기관에 해당한다.
인간의 경우, 성기는 남성(수컷)과 여성(암컷)에 따라 구조가 현저하게 다르다. 남성의 성기에는 고환, 음경, 부고환, 정관, 전립선 등이 포함되며, 여성의 성기에는 난소, 자궁, 난관, 질, 음순, 음핵 등이 포함된다.
성기는 해부학적 위치에 따라 바깥 생식기관(외부 생식기, 외생식기)과 속 생식기관(내부 생식기, 내생식기)으로 구분된다. 외부 생식기는 몸 밖으로 드러난 부분으로, 남성의 경우 음경과 음낭, 여성의 경우 대음순, 소음순, 음핵, 질 입구 등이 이에 해당한다. 내부 생식기는 체내에 위치한 기관으로, 남성의 고환과 부고환, 여성의 난소, 자궁, 난관 등이 포함된다.
일상적으로는 '성기'가 '성별이 나뉜 생물체의 생식 기관'을 가리키는 말로 사용되므로, 버섯의 자실체 등 무성생식을 하는 생물의 생식 기관은 일반적으로 성기라고 부르지 않는다. '성기'라는 용어는 영어 'sexual organ'의 직역이며, '생식기'는 'genital organ'의 직역에 해당한다.
