보키메콧쥐 또는 보키메콧가시쥐(Halmaheramys bokimekot)는 쥐과(Muridae)에 속하는 설치류의 일종이다. 할마헤라쥐속(Halmaheramys)에 속하는 2종 가운데 하나로, 인도네시아 말루쿠 제도의 할마헤라섬에서 발견되었으며 2013년에 처음 발표되었다.
종소명과 일반명은 보키메콧쥐의 모식산지인 할마헤라섬 웨다(Weda) 만 북부, 사게(Sage) 마을 북쪽에 위치한 보키 메콧(Boki Mekot) 지역의 이름에서 유래했다. 보키 메콧의 위치는 북위 00°36′42.60″, 동경 128°2′49.00″이다.
보키메콧쥐는 형태적·분자적 데이터에 확률론적 방법론을 적용하여 신종으로 확인되었으며, 발견 당시 할마헤라섬에 고유한 쥐과 종으로 알려져 있었다. 몸의 털은 긴 얼굴에 뾰족한 갈색을 띤 회색이며, 회색 배에는 강모와 가시가 섞여 있다. 꼬리 길이는 머리-몸통 길이보다 짧고 끝이 흰색이다. 다른 쥐과 종과 구별되는 특징으로는 중간 크기의 몸통, 짙은 갈색/회색을 띤 귀를 가진 중간 길이의 주둥이, 손발가락과 등 표면의 흰색 부위 등이 있다. 식성은 잡식성으로 추정되며, 육식성 경향도 있는 것으로 보인다.
보키메콧쥐의 조상은 술라웨시섬 방향에서 서쪽으로부터 할마헤라섬을 식민지화한 것으로 추정된다. 계통학적으로 보키메콧쥐가 속한 할마헤라쥐속은 순다쥐속(Sundamys), 불리머스속(Bullimus), 부노미스속(Bunomys), 파루로미스속(Paruromys) 등과 가까운 분지군에 위치한다.
할마헤라섬은 알프레드 러셀 월리스가 처음으로 식별한 아시아와 오스트레일리아 사이의 과도기 구역인 월리스(Wallacea) 생물지리학적 지역의 일부에 해당한다. 할마헤라쥐속의 또 다른 종은 2017년 인도네시아 북말루쿠 주의 비사(Bisa) 섬과 오비(Obi) 섬에서 새로 발견되어 발표되었다.
보키메콧쥐는 2019년 IUCN 적색 목록에서 평가 대상에 오르기 전 단계의 상태를 나타내는 것으로 확인된다. 해당 종이 서식하는 지역은 채굴과 삼림 벌채로 인한 서식지 위협에 노출되어 있는 것으로 알려져 있다.