무코시(일본어: 向日市)는 일본 교토부에 위치한 시(市)이다. 교토 분지 남서단에 자리하고 있으며, 서쪽으로는 오시오산을 시작으로 하는 니시야마 연봉이 있고 동쪽으로는 가쓰라가와강이 흐른다. 전체적으로 북서 방향이 고지이고 남서 방향이 저지와 평탄한 지형을 이룬다. 시역을 거의 종단하는 형태로 JR 도카이도 본선과 한큐 교토 본선이 통과한다.
면적은 7.72km²(또는 7.67km²)로 일본의 시 중에서 4번째로 좁은 면적을 가지고 있으며, 인구는 약 55,000명(2026년 7월 추계)으로 인구 밀도가 높은 편이다. 인접 지자체로는 교토시(우쿄구, 나카교구, 미나미구, 니시쿄구), 나가오카쿄시, 오야마자키정이 있다.
역사적으로 8세기 말 간무 천황이 나라에서 나가오카쿄(長岡京)로 수도를 이전하였을 때, 새로운 수도는 현 무코시의 많은 부분을 포함하고 있었다. 학자들의 연구 결과 나가오카쿄 황궁이 이곳에 위치했음이 밝혀졌다. 그러나 습기와 질병 문제로 간무 천황은 수도를 다시 헤이안쿄(오늘날의 교토)로 이전하였다. 이후 1889년 정촌제 시행으로 무코정(向日町)이 성립되었고, 1972년 10월 1일에 시로 승격되었다.
나가오카쿄시, 오야마자키정과 함께 죽순(竹筍)의 산지로 유명하며, 시화는 해바라기와 진달래, 시목은 벚꽃과 대나무이다. 해외 자매 도시로는 미국 캘리포니아주 사라토가시와 중국 저장성 항저우시가 있다.