닌나지(仁和寺)는 일본 교토부 교토시 우쿄구에 위치한 불교 사원으로, 진언종(真言宗) 오무로파(御室派)의 총본산이다. 886년 고코 천황(光孝天皇)이 창건을 시작하였고, 888년 그의 아들인 우다 천황(宇多天皇)이 완성하였다. 이후 우다 천황이 출가하여 이곳에 머물면서 황족이 주지(門跡)를 맡는 전통이 생겼으며, 이로 인해 '문적사(門跡寺)'로도 불렸다.
사원의 명칭은 창건 당시의 연호인 '닌나(仁和)'에서 유래하였다. 경내에는 국보로 지정된 금당(金堂)을 비롯하여 중요문화재인 오층탑(五重塔), 니오문(仁王門), 미에이당(御影堂) 등 다수의 문화재가 보존되어 있다. 특히 '오무로 벚꽃(御室桜)'으로 불리는 늦게 피는 벚꽃으로 유명하여 매년 봄철 많은 관광객이 방문한다.
1994년에는 '고도 교토의 문화재'의 일부로서 유네스코 세계문화유산으로 등재되었다.
