니켄야역(일본어: 二軒屋駅)은 일본 도쿠시마현 도쿠시마시에 위치한 철도역이다. 시코쿠 여객철도(JR 시코쿠)가 운영하는 무기 선의 역으로, 역 번호는 M02이다.
1913년 4월 20일에 개업하였으며, 섬식 승강장 1면 2선의 구조를 갖춘 지상역이다. 무인역으로 운영되고 있다. 상행 방면으로는 도쿠시마역·이타노역·나루토역·아나부키역 방면이, 하행 방면으로는 미나미코마쓰시마역·아난역·무기역·가이후역 방면이 연결된다.
역 주변에는 니켄야 우편국, 하치만 초등학교, 하치만 중학교, 조난 고등학교, 도쿠시마제분, 국도 제438호선 등의 시설이 위치해 있다. 역명인 '니켄야'(二軒屋)는 일본어로 '두 채의 집'을 의미하며, 이 지역의 지명에서 유래한 것으로 추정된다.