간균(杆菌, bacillus)은 막대 모양의 세균 또는 고균을 가리키는 미생물학 용어이다. 영문 명칭인 'bacillus'(복수형: bacilli)는 라틴어에서 유래하였으며, '작은 막대기'라는 의미를 지닌다. 한국어에서는 '막대균'이라고도 불린다.
간균은 특정한 분류학적 그룹에 한정되어 있지 않으며, 세균의 다양한 분류군에서 발견된다. 다만 대문자로 시작하여 이탤릭체로 표기된 Bacillus는 세균의 특정 속(屬)인 간균속을 지칭하는 학명이며, 대문자로 시작하지만 이탤릭체가 아닌 'Bacilli'는 간균강(綱)을 의미할 수 있다. 소문자로 표기된 'bacillus'는 특정 속이 아닌 단순히 막대 모양의 세균을 가리키는 일반 명칭으로 사용된다.
간균은 일반적으로 동일한 평면에서 분열하며 단독으로 존재하지만, 배열 방식에 따라 다음과 같이 구분된다.
- 쌍간균(diplobacilli): 두 개의 간균이 나란히 배열된 형태.
- 연쇄간균(streptobacilli): 여러 개의 간균이 사슬처럼 연쇄적으로 배열된 형태.
- 구간균(coccobacillus): 타원형으로 짧은 막대 모양을 띠며, 구균(원형 세균)과 유사한 형태.
간균의 대표적인 예로는 대장균(Escherichia coli), 살모넬라(Salmonella), 탄저균(Bacillus anthracis), 클로스트리디움(Clostridium), 슈도모나스(Pseudomonas), 비브리오(Vibrio) 등이 있다. 이들은 그람 염색 결과에 따라 그람 양성 간균과 그람 음성 간균으로 나뉘며, 세균의 형태와 그람 염색 결과 사이에 직접적인 연관성은 없다.